آنالیز سینتیکی و ترمودینامیکی ساختاری ‏‎rnasea‎‏ در حضور ‏‎‏‎rna‎‏ مدیفیکاسیون شیمیائی واحدهای هیستیدین

پایان نامه
چکیده

مطالعات سینتیکی و اتصالی آنزیم ‏‎rnase a‎‏ در برابر سوبسترای پلیمری ‏‎rna‎‏و نیز 3-ریبونوکلئوتیدهای آزاد، در محیط بافری تریس ‏‎edta-‎‏ (100 میلی مولار تریس؛ ‏‎ph7/5‎‏؛ 2 میلی مولار ‏‎edta‎‏) و در دمای 37 با استفاده از روش طیف نور سنجی افتراقی انجام شده است. منحنی اشباع سنتیکی آنزیم با شکل غیر هیپربولیک خود نمایانگر امکان تبدیل دو ساختار فضائی متفاوت از آنزیم به یکدیگر می باشد که در محدوده بسیار باریکی از غلظت سوبسترا واقع می گردد. در غلظتهای پائین سوبسترا بواسطه میانکنشهای فی ما بین چهار زیرجایگاه موجود در جایگاه فعال آنزیم، تجلی منحنی اشباع سینتیکی آنزیم به شکل یک تابع سیگموئیدی است که خاص سیستم های آنزیمی متعاون با تعاون مثبت می باشد. در غلظتهای بالاتری از سوبسترا، تغییر بنای فضائی آنزیم بهمراه کاهش مشخصی از تعاون مثبت در مقابل افزایش چشمگیر ثابت سرعت کاتالیزوری آنزیم روی می دهد. شکل چند پله ای منحنی اتصالی آنزیم در حضور 3- ریبونوکلئوتیدهای آزاد نشان دهنده وجود چهار زیر جایگاه پیوندی است که سه زیر جایگاه اول جهت اتصال سه بخش از اولین نوکلئوتید متصل شونده به آنزیم (فسفات، ریبوز و باز) اختصاص یافته است و طریقه اتصال با الگوی منظم 3- فسفات ریبوز باز 5 صورت می گیرد. چهارمین زیر جایگاه اتصالی نیز متعلق به دومین گروه فسفات از دومین نوکلئوتید متصل شوند به آنزیم می باشد. ترتیب برای واحدهای نوکلئوتیدی موجود در ساختمان ‏‎rna‎‏ برخلاف نحوه اتصال 3- ریبونوکلئوتیدهای آزاد به شکل 5-فسفات ریبوز باز 3 صورت می گیرد. نقش کاتالیزوری و ساختمانی اسیدهای آمینه هیستیدین در پیکره آنزیم ریبونوکلئاز لوزالمعده گاز ‏‎(rnase a)‎‏ با استفاده از روشهای مدیفیکاسیون شمیائی واحدهای هیستیدین؛ محاسبه سطح در دسترس اسیدهای آمینه ‏‎(asa)‎‏؛ اسپکتروفلوئورومتری؛ اسپکتروسکوپی ‏‎uv-cd‎‏؛ گرماشنجی رویشی افتراقی ‏‎(dsc)‎‏؛ کروماتوگرافی با کارکرد عالی ‏‎(hplc)‎‏ و همچنین سنجش میزان فعالیت آنزیمی در شرایط بافر تریس‏‎edta-‎‏ (100 میلی مولار تریس؛ ‏‎ph 7/5‎‏؛ 2 میلی مولار ‏‎edta‎‏) و دمای ‏‎37c‎‏ بررسی شده است. مطالعات انجام شده نشان می دهد که از چهار واحد هیستیدین موجود در ساختمان آنزیم تنها سه واحد هیستیدین توسط معرف شیمیایی دی اتیل پیروکربنات ‏‎(depc)‎‏ مدیفاید می شود و هیستیدین چهارم عملا توسط معرف مذکرو قابل دستیابی نمی باشد. به علت عدم امکان استفاده از روابط و معادلات ترمودینامیکی سیستم های پروتئینی بازگشتی که بر پایه ترمودینامیک تعادلی استوار گشته اند تجزیه و تحلیل منحنیهای واسرشتی حرارتی برای سیستم های پروتئینی غیر بازگشتی نیازمند ارائه معادلات جدیدی می باشد که امکان تفکیک یک منحنی واسرشتی حرارتی را به زیر پیک های سازنده آن فراهم می سازد. در چنین شرایطی میتوان تعداد حد واسطهای موجود در روند واسرشتی حرارتی یک پروتئین را مشخص نمود. در اینجا، پایه گذاری و استفاده از چنین معادلاتی درمورد یک سیستم پروتئینی غیر بازگشتی و چند زیر واحدی نظیر هموگلوبین مشخص ساخته است که این پروتئین، طی واسرشتی حرارتی خود از سه حد واسط پایدار گذر می کند.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

ویژگی‌های سینتیکی آنزیم اوره‌آز در حضور رس‌های سپیولیت و ورمیکولیت

Urea is one of the most commonly used nitrogen fertilizers in agricultural lands. The fate of this fertilizer in soils is greatly related to the soil urease enzyme activity, while this enzyme commonly exists in the adsorbed state on the surface of soil colloids, and especially clay minerals. In order to examine the kinetic properties of free and adsorbed Urease on the surface of sepiolite and v...

متن کامل

بررسی آزمایشگاهی و مدل سازی ترمودینامیکی تشکیل هیدرات پروپان در حضور بهبود دهنده های ترمودینامیکی نامحلول

امروزه با توجه به مزایای هیدرات در انتقال وذخیره سازی گاز طبیعی، این موضوع مورد توجه محققین قرار گرفته است. همچنین با توجه به شرایط تشکیل هیدرات که در دمای پایین وفشار بالایی می باشد سعی شده است این شرایط به شرایط محیطی نزدیک شود و برای این کار از افزودنی هایی استفاده شده است که این نقاط ترمودینامیکی را تغییر می دهد. برای پیش بینی این نقاط، مدل های ترمودینامیکی نیز وجود دارد که غالباٌ دارای ثواب...

متن کامل

اثر نسبت مولی اصلاح‌کننده به نانوذرات تیتانیا در حذف استرانسیم و مطالعات سینتیکی و ترمودینامیکی مربوط

در این پژوهش نانوذرات تیتانیا به‌وسیله‌ی 2– آمینو اتیل دی هیدروژن فسفات، با نسبت‌های مولی متفاوت اصلاح سطح شد. هدف از این نوع اصلاح سطح، بهبود ویژگی‌های جذبی نانو ذرات تیتانیا و تبدیل آن به یک جاذب ارزان و کارآمد برای جذب استرانسیم از محلول‌های آبی بوده است. بر اساس نتیجه‌های به‌دست‌ آمده از آزمایش‌های مشخصه‌یابی، با افزایش نسبت مولی گروه اصلاح‌کننده به نانو ذرات تیتانیا از 0/05 تا 0/25 درصد جذ...

متن کامل

بررسی سینتیکی تشکیل هیدرات اتیلن در حضور سوسپانسیون نانوذره نقره

در این پژوهش سینتیک تشکیل هیدرات اتیلن در حضور سوسپانسیون نانوذره­ ی نقره بررسی شد. زمان القای هیدرات اتیلن در فشارهای 14 و 16 بار و دمای 4 درجه­ ی سلسیوس اندازه‌گیری شد. زمان القای هیدرات اتیلن در تمامی غلظت‌های سوسپانسیون نانوذره نقره نسبت به آب خالص کاهش یافت. کم ­ترین زمان القا در فشار 14 بار، 21 دقیقه و در فشار 16 بار 17 دقیقه بود که نسبت به آب خالص به ترتیب 93 درصد و 87 درصد کاهش دیده...

متن کامل

بررسی ترمودینامیکی احیای کربوترمی مولیبدنیت در حضور اکسید منیزیم

Carbothermic reduction of Molybdenite in the presence of Magnesium oxide was thermodynamically studied. The stability diagrams for MoS2-MgO and MoS2-MgO-C Systems was prepared. The reduction of MoS2 with Carbon in the presence of Magnesium oxide proceeded through the direct oxidation of MoS2 by MgO to form intermediate molybdenum oxidized Species, MoO2 and MgMoO4. The results showed that the g...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023